《企業(yè)所得稅核定征收辦法》中，對(duì)于一些具體標(biāo)準(zhǔn)沒(méi)有明確規(guī)定，導(dǎo)致應(yīng)稅所得率幅度差別大。雖然文件中第八條規(guī)定了各行業(yè)的企業(yè)所得稅核定征收率，但各行業(yè)之間的具體劃分標(biāo)準(zhǔn)并沒(méi)有明確規(guī)定，導(dǎo)致實(shí)際操作中，對(duì)行業(yè)的劃分存在差異，繼而出現(xiàn)應(yīng)稅所得率幅度的差異。如建筑業(yè)的企業(yè)所得稅核定稅率為8%-20%，其中建筑業(yè)中裝飾行業(yè)的所得稅率為15%，其他建筑業(yè)所得稅核定征收率為8%。許多建筑企業(yè)的經(jīng)營(yíng)范圍中既包括建筑也包括裝飾，但企業(yè)在申報(bào)稅款時(shí)，為了利益化，往往會(huì)將收入都記入建筑業(yè)項(xiàng)目，以此來(lái)偷逃稅款。

在我國(guó)核定征收的司法實(shí)踐中被告完成證明責(zé)任的案件有30件核定征收崇明，占到了案件總量的65%。還有很大一部分案件中，被告無(wú)法完成證明責(zé)任。更有甚者核定征收崇明，將證明自身合法的責(zé)任反加于原告身上，由于法律規(guī)定的模糊，原告很難自證清白。在實(shí)證分析中我們也發(fā)現(xiàn)，原告完成反證的案件有4件，只占案件總量的9%。而且，根據(jù)納稅人誠(chéng)信推定原則，納稅人、稅務(wù)機(jī)關(guān)的舉證責(zé)任也要進(jìn)行合理分配。一方面核定征收崇明，為了保護(hù)納稅人的合法權(quán)益，防止稅務(wù)機(jī)關(guān)濫用征稅權(quán)，對(duì)于納稅人的納稅行為存在瑕疵的證明義務(wù)，應(yīng)歸于稅務(wù)機(jī)關(guān)。另一方面，稅務(wù)機(jī)關(guān)在證明納稅人的納稅行為違法時(shí)，在不同的階段有不同的證明程度和標(biāo)準(zhǔn)。

關(guān)于核定征收的概念，各個(gè)稅收征收法律法規(guī)中并沒(méi)有具體解釋，但許多學(xué)者對(duì)核定征收做了自己的解釋，通過(guò)這些解釋有助于我們更好地理解核定征收的概念和適用的范圍。曰本學(xué)者金子宏認(rèn)為，核定征收又叫推計(jì)課稅、推算課稅，是指稅務(wù)署長(zhǎng)在對(duì)所得稅或法人稅實(shí)施或決定行為時(shí)，不是根據(jù)直接資料，而是運(yùn)用各種間接資料進(jìn)行所得認(rèn)定的方法。 我國(guó)學(xué)者施正文認(rèn)為，推計(jì)課稅是稅務(wù)機(jī)關(guān)在進(jìn)行稅款征納中，不是依據(jù)納稅人提供的直接稅務(wù)資料，而是使用其他的各種間接資料，來(lái)認(rèn)定課稅要件所依據(jù)的事實(shí)的方法。 劉劍文認(rèn)為，應(yīng)納稅款的核定，是指在法定情形下，征稅機(jī)關(guān)運(yùn)用稅款核定權(quán)核定納稅人應(yīng)納稅額的制度。

多個(gè)收入來(lái)源和單一收入來(lái)源的納稅人，如果收入總額相同，則存在繳納不同稅款的情況。多個(gè)收入來(lái)源的納稅人，分別按不同稅目多次扣除免征額，則可能不征或少征稅;單一收入來(lái)源的納稅人，因扣除少，勢(shì)必要多交稅款。在橫向公平與縱向公平方面顯現(xiàn)出來(lái)的各種問(wèn)題，歸根結(jié)底是因?yàn)楝F(xiàn)行稅制設(shè)計(jì)、稅收征管、稅收征收環(huán)境等多方面的原因造成的偏差。

納稅人的協(xié)力義務(wù)定義為：在稅收行政過(guò)程中，納稅人及扣繳義務(wù)人有協(xié)助稅務(wù)機(jī)關(guān)闡明課稅事實(shí)、實(shí)現(xiàn)經(jīng)濟(jì)、公平課稅的義務(wù)氣法律上應(yīng)有明確的規(guī)定，納稅人的的協(xié)力義務(wù)只能協(xié)助稅務(wù)機(jī)關(guān)闡明課稅事實(shí)，這種協(xié)助只適用稅款征收過(guò)程中。這樣可以保護(hù)納稅人合法利益不受侵害核定征收崇明，防止稅務(wù)機(jī)關(guān)以納稅人提供協(xié)力義務(wù)為由，濫用職權(quán)強(qiáng)迫納稅人提供其他無(wú)關(guān)的信息資料，甚至索要賄賂。

稅收核定征收權(quán)司法控制的本質(zhì)稅收核定征收權(quán)是行政權(quán)，而司法控制是法院在行使司法權(quán)。所以，稅收核定征收權(quán)司法控制的本質(zhì)是司法權(quán)和行政權(quán)的互動(dòng)關(guān)系。與立法權(quán)具有的普適性不同，司法權(quán)和行政權(quán)都有具體性，是作用于具體事項(xiàng)的權(quán)力。但二者也有區(qū)別：行政權(quán)有主動(dòng)性，自主作用于行政事務(wù)，履行其社會(huì)管理等方面的職能；而司法權(quán)有被動(dòng)性，遵循不告不理的原則，履行其解決爭(zhēng)端的職能。行政權(quán)與司法權(quán)的聯(lián)系，表明二者可以針對(duì)同一具體事項(xiàng)共同發(fā)揮作用；其間的區(qū)別可以使二者相互制約、互為補(bǔ)充。二者的互動(dòng)關(guān)系具體體現(xiàn)為司法權(quán)對(duì)行政權(quán)的監(jiān)督和行政權(quán)向司法領(lǐng)域的滲透。